A klub 1927-ben alakult meg egy amatőr csapat, a Dinamo egyik szakosztályaként, ami a Szovjetunió első, később országossá váló sportegyesülete volt. Ez az egyesület aztán előbb az NKVD (НКВД), majd a szovjet Belügyminisztérium (MVD) befolyása alá került. Az 1950-es és '80-as évek között maguk a játékosok is rendelkeztek valamilyen hivatalos rendőrségi vagy honvédségi beosztással.

A szovjet érában a klub egyike, sőt gyakran egyetlen ellenfele volt a moszkvai futballkluboknak. A Dinamo azzal, hogy meg tudta törni a moszkvai klubok dominanciáját és rekordnak számító 13 alkalommal lett szovjet bajnok, Ukrajna nemzeti büszkeségévé vált. Az Ukrán SZSZK vezetői nem hivatalosan nemzeti csapatukká kiáltották ki és általános támogatásban részesítették. A szovjet bajnokságban sikeressé váló gárda két alkalommal európai kupasikernek is örülhetett, megnyervén a Kupagyőztesek Európa Kupáját 1975-ben és 1986-ban.

A Szovjetunió összeomlása után - már az ukrán Dynamo Kyiv nevet használva - a klub Ukrajna új labdarúgó ligájának tagja lett. A Dynamo hazai vezető státusza nem változott, hiszen az első ukrán bajnokságot még a Tavrija Szimferopol nyerte meg, ám utána a kijeviek évtizede következett, és rövidesen dominánssá váltak az ukrán bajnokságban valamint a kupasorozatban. Ezt a dominanciát a közelmúltban Kelet-Ukrajna legerősebb csapatának, az FC Sakhtar Donyecknek sikerült megtörnie, amely 2002-ben, 2005-ben, és 2006-ban is bajnok lett, mindhárom alkalommal a Dynamo előtt végezve.

A fennállásának 80. évfordulóját ünneplő kijevi klub 2007-ben aztán mindent megnyert amit hazai fronton lehet: a bajnokságot, a kupát, és az ukrán szuperkupát is - elmondható tehát, hogy a Dynamo visszaült Ukrajna trónjára.